首先，我國冷鏈物流硬件運輸設備和基礎設施缺乏、陳舊，并且發展和分布不均衡是制約冷鏈物流發展的重要原因。與發達國家比較，冷鏈物流硬件運輸設備和基礎設施嚴重不足，并且原有設施陳舊老化、分布不均，無法為冷鏈運輸食品流通提供溫度保障。在我國，食品冷鏈物流采用率比較低，一些冷鏈運輸食品在物流配送中并沒有使用冷藏車。
　　其次，行業標準不完善。目前冷鏈物流行業標準除了標準本身的不規范，還包括標準制定者的不規范。該行業標準是由相關企業來制定的，在標準的內容上不免失去公正客觀性。雖然越來越多的協會和部門都開始制定冷鏈的相關標準，但在內容上，地方標準、行業標準、國家標準相互交叉，沒有統一的規范，導致標準體系建設很不完善。
　　此外，缺乏系統冷鏈物流管理。在目前的冷鏈物流市場中，冷鏈體系管理仍是一片空白，多數企業都還在低水平運作。企業較強的整合能力與管理水平等軟實力成為其有冷鏈效保障物流供應鏈運作的必要條件。企業要采取多種途徑，鍛造企業管理軟實力。要增強冷鏈物流供應鏈管理水平建設，通過管理模式的升級，對冷鏈物流供應鏈整體服務水平進行統一規劃，打造靈活高效的冷鏈物流管理系統，提升運作效率，減少相應損耗。