醫藥配送中心倉儲管理，是配送中心倉儲運作諸多重要環節的有機組合。其內容主要包括設施設備、計算機系統、倉儲人員、藥品儲存、保管與養護、安全管理、溫濕度管理、藥品檢查處理、效期管理、衛生管理、庫存盤點等諸多方面。
倉儲管理涉及的對象包括人員、環境、場地、藥品等，涉及的工具包括倉儲設備、計算機系統、倉儲制度流程、考核方案等，涉及的要素包括貨物的進銷存、環境的溫濕度、操作的時間和效率等，涉及的指標包括庫存品項差異率、庫存周轉天數、庫存損失下貨率、庫存損耗率等，可謂環節眾多、指標多樣、流程瑣碎、事務繁雜。因此，在日常管理當中，務必要做到分清主次、合理安排、認真梳理、規范操作、現場監管、落實考核等。
設施設備
企業應具有與其藥品經營范圍、經營規模相適應的經營場所和庫房。
庫房的選址、設計、布局、建造、改造和維護應當符合藥品儲存的要求，防止藥品的污染、交叉污染、混淆和差錯。
藥品儲存作業區、輔助作業區應當與辦公區和生活區分開一定距離或者有隔離措施。
庫房的規模及條件應當滿足藥品的合理、安全儲存，并達到以下要求，便于開展儲存作業
1．庫房內外環境整潔，無污染源，庫區地面硬化或綠化；如獨立園區倉庫外建設水泥地面和綠化帶等。
2．庫房內墻、頂光潔，地面平整，門窗結構嚴密；如倉庫內墻刷白、平整、光潔，倉庫內建設水磨石地面，通道口安裝相應的消防門、防盜門、卷閘門等。
3．庫房有可靠的安全防護措施，能夠對無關人員進入實行可控管理，防止藥品被盜、替換或者混入假藥；如安裝CCTV視頻監控系統。
4．有防止室外裝卸、搬運、接收、發運等受異常天氣影響的措施，如庫外構筑裝卸月臺、搭建雨棚等。
庫房應當配備的設施設備和專用場所
1.藥品與地面之間有效隔離的設備，比如搭建高層貨架和輕型貨架并擺放和陳列貨物、使用墊板堆碼貨物等。
2.避光、通風、防潮、防蟲、防鼠等設備；比如安裝窗簾、帶網格的換氣扇、紫外熒光燈，放置捕鼠器等。
3.有效調控溫濕度及室內外空氣交換的設備；如安裝空調、抽濕機、換氣扇等。
4.自動監測、記錄庫房溫濕度的設備；如安裝帶探頭的智能溫濕度計等。
5.符合儲存作業要求的照明設備；如安裝防爆燈具等。
6.用于零貨揀選、拼箱發貨操作及復核的作業區域和設備；如安裝電子標簽，使用電腦、RF掃描槍、手持PDA、周轉箱、周轉筐等開展揀選、發貨與復核操作。
7.包裝物料的存放場所；如設置物料庫、物料區等。
8.驗收、發貨、退貨的專用場所；如設置待驗區、發貨區、退貨驗收區等。
9.不合格藥品專用存放場所；如設置不合格品區。
