1、自動化立庫系統的結構相對復雜，相關的配套設備較多，企業的投入成本相對較多。

2、自動化立庫貨架系統一般高度在10-30M之間，所以對貨架系統的穩定性和堅固性要求比較高，所以立庫貨架在生產時要保證貨架的精度和質量。

3、自動化立庫貨架系統對貨物的批量處理能力很強，適合量大品少的貨物存儲，不適合品類多量小繁雜的貨物存儲。

4、自動化立庫貨架系統的維護要求高，因此必須依賴供應商，以便在系統出現故障時能得到及時的技術援助。這就增強了對供應商的依賴性。

5、自動化立庫貨架系統的使用需要充分考慮環境變化對貨物的影響，比如考慮好倉庫的供電和通風等問題，防止突發情況對貨物造成的損失。