當前，第三方物流企業對倉庫管理還存在很多問題，沒有實現降本增效，企業要想控制總成本，就要加強庫存管理。在引進先進的、現代化的庫存管理理念的同時，還要結合企業自身情況靈活運用，不斷提升綜合管理能力和綜合競爭力。
　　物流公司倉庫管理系統(WMS)的運用
　　物流公司倉庫管理系統是通過入庫業務，出庫業務、倉庫調撥、庫存調撥和虛倉管理等功能，綜合批次管理、物料對應、庫存盤點、質檢管理、虛倉管理和即時庫存管理等功能的管理系統，有效控制并跟蹤倉庫業務的物流和成本管理全過程，實現完善的企業倉儲信息管理。同時引入條形碼管理系統，去掉了手工書寫票據和送到機房輸入的步驟，解決庫房信息陳舊滯后的弊病。條碼技術與信息技術的結合幫助企業合理有效地利用倉庫空間，以快速、準確、低成本的方式為客戶提供最好的服務。　　
        物流公司倉庫管理5S現場管理
　　5S現場管理最早來源于日本豐田汽車公司的管理實踐中總結出來的寶貴經驗，它可以使企業的生產環境得到極大地改善，是企業走上成功之路的重要手段。5S來自日文SEIRI(整理)、SEITON(整頓)，SEISO(清掃)、SEIKETSU(清潔)、SHITSUKE(修養)發音的第一個字母"S"，所以統稱為"5S"。5S塑造企業的形象、降低成本、準時交貨、安全生產、高度的標準化，創造令人心曠神怡的工作場所、現場改善等方面發揮了巨大作用，也是物流公司倉庫管理活動有效開展的基石之一，現已逐漸被各國的管理界所認識。
　　物流公司倉庫管理ABC分類管理
　　ABC分類管理就是將庫存物品按品種和占用資金的多少分為特別重要的庫存(A類)，一般重要的庫存(B類)和不重要的庫存(C類)三個等級，然后針對不同等級分別進行管理與控制的方法。
　　物流公司倉庫管理零庫存思想
　　零庫存思想：實現零庫存的根本途徑就是實施準時化作業，如準時化采購、準時化生產、準時化配送、準時化銷售等。準時化的思想就是只在需要的時候把需要的品種和數量送到需要的地點。在我國，庫存成本對物流成本的影響很大，要控制總成本，就要加強庫存管理，加快庫存周轉，壓縮平均庫存量。但是企業也不能盲目壓縮庫存量，其實，零庫存技術是指在生產與流通領域按照JIT組織物資供應，使整個過程庫存最小化的技術的總稱，而并非單純的從數量上使得庫存為零。
　　供應商管理用戶庫存(VMI)
　　供應商管理用戶庫存：這種庫存管理策略打破了傳統的各自為政的庫存管理模式，體現了供應鏈的集成化管理思想，適應市場變化的要求，是一種新的有代表性庫存管理思想。供應商管理庫存是供應商等上游企業基于其下游客戶的生產經營、庫存信息，對下游客戶的庫存進行管理與控制，可以緩解和抑制"牛鞭效應"，能夠突破傳統的條塊分割的庫存管理模式，以系統的，集成的管理思想進行庫存管理，使供應鏈系統能夠獲得同步化的運作。