第三方倉儲管理，指的是倉儲系統的布局設計、貨物的保存、倉儲如何進行操作。它們性質不同卻很相近。
一、倉儲系統的布局設計
倉儲系統有三大運輸主要干線：鐵路、公路和船舶。在區域內送貨是主要地區，其他為副中心地區，這就形成了一個完整的布局系統模式，避免了復雜混亂的局面。樞紐顧名思義是配送中心，基地是倉庫。與此同時還需要對配送中心的選址規劃、倉儲系統內的設施設備進行安排，規劃好庫存區域。
二、庫存控制
倉庫以倉儲系統的布局設計為依據對本倉庫的管理目標和管理模式進行確定。這樣，才能確定倉庫的商業模式。
（1）將控制目標定位在服務質量和運營成本上，控制庫存的量，避免貨量過多過少現象出現。
（2）服務質量、運營成本、計費系統、客戶關系管理將會成為重要控制目標，實現企業利潤最大化。
（3）物流倉儲管理中庫存控制有執行、反饋和分析。
三、倉儲管理中的操作
倉儲作業操作包括進倉、盤點、賬務處理、出倉等，在第三方物流的倉儲管理中，是以倉庫管理系統為中心來進行主導管理。信息化管理對倉庫控制的集成化起重要作用。
(1)進倉作業流程
首先是審核接收的單據，然后開始檢查車輛，再卸貨，驗貨，驗收成功后系統指導上架，并對貨品進行貼簽掃描，單據處理后最后入賬。
(2)盤點作業流程
制訂盤點計劃，然后盤點，對實物和標簽核對，盤點表與系統賬務進行復核，最后計算庫存準確率。
(3)出倉作業流程
接單審單，然后把貨品系統分配，分揀備貨，發貨，復核交接，單據處理，最后銷賬。
(4)賬務處理
實時記錄和檢查進出庫作業、質量狀態、數量的改變；同時，對貨品進行分類、整理、歸檔保存、備份相關憑證。