根據專業人士表示，各公司由于管理方式不一樣，倉庫所歸屬的部分也是不一樣的，有歸屬計劃部的、PMC部的、獨立的倉儲部等等。但是專業人士表示，倉庫不能歸屬以下幾個部門：
1、生產部或制造中心不能管理倉庫：因為如果生產部或制造中心來管理倉庫部門的話，就會造成領用數不清晰，有些領用人員不按倉庫管理制度去辦事，有些管理人員也會忽視、以生產為中心為借口隨意去倉庫拿物資，這樣會造成倉庫數據不清晰，財務核算不準確。
2、采購部或采購中心不能管理倉庫：因為采購部的采購員采購回來的物資要經倉庫管理員來清點其數量，數量的多少與付出的款項有關系，如果由采購部來管理倉庫是不符合企業的內部牽制制度的－也就是采購部又當運動員又當裁判。
3、物流部門不能管理倉庫：物流部門是對外配送物資的窗口，如果物流部管倉庫會造成管理者劃分不清晰其發錯貨的責任，是倉庫發錯了還是物流部在配送過程中出錯呢？也許有的人認為反正是一家人，誰出錯都有責任，其實這樣是不行的，不能清晰的劃分責任對于追究責任的人與責任人都不可取的。
4、營銷部門不能管理倉庫：營銷部門是做業務的部門，往往會以業務為中心，隨意性很大，所以如果要他管理倉庫經常會犯不把物流部放在眼里－也就是不經物流部就把貨物發出去，但是出了錯又是物流部的責任。
相信很多讀者都會問一個問題，倉庫歸哪個部門管理會更有利于企業發展呢？專業人士表示，其實管理倉庫的部門最好是與物資發放的對內、對外的窗口沒有任何關系的部門來管理，況且數據管理、系統管理、物資存放常識都很專業的部門，那么大家思考一下，一個企業這個部門有幾個呢？只的兩個部門：
一是財務部（倉庫的進、銷、存系統財務一定是要監管的，倉庫的盤點工作財務是要監盤的，財務人員的原則性及對物資的管理的專業性都比較強，所以說由財務部來管倉庫是比較科學的，但是為何許多企業的財務部都不喜歡管理倉庫呢？其實最重要的是倉庫要面對許多的部門，而這些部門如果在老板的眼里比財務更重視時，往往財務部管理得很嚴格或非常講原則時，老板會偏向其部門，所以財務部的領導往往考慮出力又不討好的角度來思考，把倉庫踢給喜歡方便的部門來管理，當每個月的數據不準確時，就把其全部責任推給管理倉庫的部門，其實最終吃虧還是老板）。
二是物控部（但是如果物控部管理物流配送的話，管理倉庫也不是很適合，如果不是就可以），有的大型的企業單獨設物控部或倉儲部，如果能找到責任心強、又專業的人來管理是最科學的管理方法，每個月由財務部對企業的所有物資進行監盤。但是這種單獨設置倉儲部或物控部的企業不多，這大都適合大型的商業企業、營銷公司、產值非常大的工業企業等，中小型工業企業不適合。